Celkové riešenie mikrobiologického laboratória je odlišné od všeobecného laboratórneho inžinierstva alebo purifikačného inžinierstva podľa bezpečnostných požiadaviek a požiadaviek laboratória na použitie.Laboratóriá používané najmä v mikrobiológii, biomedicíne, biochémii, pokusoch na zvieratách, genetickej rekombinácii a biologických produktoch sa súhrnne označujú ako laboratóriá biologickej bezpečnosti.Laboratórium biologickej bezpečnosti pozostáva z hlavného laboratória laboratórnej funkcie a ďalších laboratórií a pomocných funkčných miestností.Laboratóriá biologickej bezpečnosti musia zabezpečiť osobnú bezpečnosť, bezpečnosť životného prostredia, bezpečnosť odpadov a vzoriek, dlhodobú a bezpečnú prevádzku a zároveň poskytovať pohodlné a dobré pracovné prostredie pre zamestnancov laboratórií.
Mikrobiologické laboratórium má miestnu 100-úrovňovú bakteriálnu testovaciu miestnosť, hubovú testovaciu miestnosť, patogénnu testovaciu miestnosť, umývaciu a dezinfekčnú miestnosť, miestnosť na kultiváciu plesní, miestnosť na bakteriálne kultúry a miestnosť na identifikáciu nástrojov na mikroorganizmy, prípravu kultivačného média miestnosť, miestnosť na uchovávanie kmeňov.
